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Connaître la démarche du diagnostic microbiologique quand les hémocultures initiales sont négatives OIC-152-09-B

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Des hémocultures sont considérées négatives en l’absence d’identification d’un pathogène après 5 jours de culture.

Dans moins de 5 à 10% des cas, les hémocultures ne permettent pas d'identifier d’agent infectieux (endocardite à hémocultures négatives). Il peut s’agir de:

  • Bactéries à croissance lente ou difficile
    • bactéries du groupe HACEK à croissance lente
    • streptocoques déficients (ex: Granulicatella spp., Abiotropria spp....)
    • bactéries à développement intracellulaire et non cultivables (ex: Coxiella burnetii, Bartonella spp.…)
  • Levure (Candida étant le plus fréquemment en cause)
  • Antibiothérapie préalable
  • Endocardites non infectieuses (rares endocardites d'origine lupique ou marastique d'origine néoplasique)

La première cause à évoquer est l’administration préalable d’une antibiothérapie qu'il convient de rechercher à l’interrogatoire. Dans ce cas, l’antibiothérapie peut être interrompue 72 heures, avant de répéter les hémocultures (3 prélèvements sur 24 heures), en l’absence de critères nécessitant un traitement urgent (sepsis ou choc septique, végétation, abcès ou destruction valvulaire).

En l’absence d’antibiothérapie préalable, le bilan d’EI à hémocultures négatives sera complété par :

  • Hémocultures à incubation prolongée
  • Sérologie Coxiella burnetti
  • Sérologie Bartonella spp.
  • Un avis spécialisé doit être demandé et le laboratoire de microbiologie doit être informé de la suspicion d’EI pour discuter d'investigations complémentaires (PCR, sérologies, techniques particulières d'hémocultures...).

Enfin, si une indication chirurgicale est indiquée avant l'identification de l'agent pathogène, l'analyse bactériologique de la valve, des végétations ou de tout matériel retiré peut permettre d'étayer le diagnostic.




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Dans moins de 5 à 10% des cas, les hémocultures ne permettent pas d'identifier d’agent infectieux (endocardite à hémocultures négatives). Il peut s’agir de:

  • Bactéries à croissance lente ou difficile
    • bactéries du groupe HACEK à croissance lente
    • streptocoques déficients (ex: Granulicatella spp., Abiotropria spp....)
    • bactéries à développement intracellulaire et non cultivables (ex: Coxiella burnetii, Bartonella spp.…)
  • Levure (Candida étant le plus fréquemment en cause)
  • Antibiothérapie préalable
  • Endocardites non infectieuses (rares endocardites d'origine lupique ou marastique d'origine néoplasique)

La première cause à évoquer est l’administration préalable d’une antibiothérapie qu'il convient de rechercher à l’interrogatoire. Dans ce cas, l’antibiothérapie peut être interrompue 72 heures, avant de répéter les hémocultures (3 prélèvements sur 24 heures), en l’absence de critères nécessitant un traitement urgent (sepsis ou choc septique, végétation, abcès ou destruction valvulaire).

En l’absence d’antibiothérapie préalable, le bilan d’EI à hémocultures négatives sera complété par :

  • Hémocultures à incubation prolongée
  • Sérologie Coxiella burnetti
  • Sérologie Bartonella spp.
  • Un avis spécialisé doit être demandé et le laboratoire de microbiologie doit être informé de la suspicion d’EI pour discuter d'investigations complémentaires (PCR, sérologies, techniques particulières d'hémocultures...).

Enfin, si une indication chirurgicale est indiquée avant l'identification de l'agent pathogène, l'analyse bactériologique de la valve, des végétations ou de tout matériel retiré peut permettre d'étayer le diagnostic.



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