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Connaître les bases du traitement de l'information en santé (codage, gestion, publication, évaluation) OIC-018-06-A

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Version Novembre 2024

1        Représentation de l’information en santé

1.1       Définition et sources des données de santé :

Données relatives à la santé physique ou mentale, passée, présente ou future, d’une personne physique (y compris la prestation de services de soins de santé) qui révèlent des informations sur l’état de santé de cette personne (RGPD) :

  • Proviennent de différentes sources : le patient, le système de soins, la recherche, les registres, etc.
  • Peuvent être (ré)utilisées pour différentes finalités : soins, financement, recherche, pilotage, vigilances, enseignement.
  • Peuvent être collectées sous différents formats :
    • Non-structuré : par exemple, les comptes-rendus en texte libre.
    • Semi-structuré : par exemple, les formulaires dans un dossier patient informatisé. Il existe une structure explicite permettant de classer les différentes informations (ex : l’observation médicale).
    • Structuré : par exemple, les formulaires qui alimentent la base nationale sur les maladies rares. La saisie des données est contrainte par une terminologie prédéfinie qui associe à chaque information un nombre et/ou un code.

Le traitement des données est d’autant plus aisé que leur niveau de structuration est important. Certaines utilisations des données peuvent nécessiter de faire passer des données d’un format non structuré à un format structuré en les codant selon des terminologies.

1.2       Codage de l’information : exemple du PMSI

Le Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information a pour but de décrire l’activité d’hospitalisation de tous les établissements de santé en France. Le PMSI sert à la compensation financière des établissements de santé suite à la mise en place de la tarification à l’activité (T2A).

Exemple de codage du diagnostic principal d’un séjour dans une unité médicale de chirurgie orthopédique



PMSI : dans chaque établissement de santé, les Départements d’Information Médicale transmettent mensuellement des informations à l’Agence Régionale de Santé. Ces informations issues des données des dossiers du patient sont codées selon des terminologies : par exemple, la CIM-10 (Classification Internationale des Maladies version n°10) pour les diagnostics et la CCAM (Classification Commune des Actes médicaux) pour les actes médicaux.


2        Gestion de l’information médicale

2.1       Au niveau local

2.1.1      Pour le soin

Le système d’Information Hospitalier (SIH)

Il est composé de logiciels interconnectés et spécialisés. Par exemple, les activités liées à l'imagerie reposent sur le système de radiologie (scanner, IRM, échographe, etc.), des logiciels de gestion des images (PACS) et de production des comptes rendus. Le dossier patient informatisé (DPI) est un composant logiciel essentiel d'un SIH. Il centralise l'ensemble des données du patient produites à l'hôpital et permet aux professionnels de santé d'échanger des informations.

Le système d’information hors établissement de santé

Les cabinets médicaux sont dotés de systèmes comprenant des équipements (réseau, PC, lecteur de carte CPS et SESAM-Vitale, imprimante-scanner, etc.) et un logiciel de gestion du cabinet offrant des fonctionnalités de gestion de rendez-vous, dossier médical, prescriptions et import des résultats d'analyses de biologie médicale.

2.1.2      Pour des finalités autre que le soin

Les entrepôts de données de santé permettent de décloisonner les données produites lors du processus de soins et de les intégrer dans une même base, afin de les réutiliser à d’autres fins que le soin (ex : la recherche, les vigilances, le pilotage).

2.2       Au niveau national

2.2.1      Pour le soin

Mon espace santé est une plateforme comportant le dossier médical partagé entre des professionnels de santé, une messagerie sécurisée, des services applicatifs afin de faciliter la communication entre les professionnels de santé et le patient.

2.2.2      Pour des finalités autres que le soin

Le système national des données de santé est un dispositif national qui intègre plusieurs bases de données, notamment : les données du Système National d’Information Inter-régimes de l’Assurance Maladie (SNIIRAM), les données PMSI, les causes médicales de décès et les données relatives au handicap.

3        Publication, évaluation

Pour une partie d’entre eux, les indicateurs de qualité et sécurité des soins (IQSS) développés par l'HAS reposent directement sur des données de santé :

  • les indicateurs sur dossier du patient : sur la tenue du dossier du patient, la qualité de la lettre de liaison à la sortie, l'évaluation et la prise en charge de la douleur, le dépistage des troubles nutritionnels, etc.
  • les indicateurs calculés à partir de la base nationale du PMSI : les réadmissions dans les 7 jours suivant un séjour conventionnel, les réadmissions dans les 3 jours après une chirurgie ambulatoire, etc.



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Version Novembre 2024

1        Représentation de l’information en santé

1.1       Définition et sources des données de santé :

Données relatives à la santé physique ou mentale, passée, présente ou future, d’une personne physique (y compris la prestation de services de soins de santé) qui révèlent des informations sur l’état de santé de cette personne (RGPD) :

  • Proviennent de différentes sources : le patient, le système de soins, la recherche, les registres, etc.
  • Peuvent être (ré)utilisées pour différentes finalités : soins, financement, recherche, pilotage, vigilances, enseignement.
  • Peuvent être collectées sous différents formats :
    • Non-structuré : par exemple, les comptes-rendus en texte libre.
    • Semi-structuré : par exemple, les formulaires dans un dossier patient informatisé. Il existe une structure explicite permettant de classer les différentes informations (ex : l’observation médicale).
    • Structuré : par exemple, les formulaires qui alimentent la base nationale sur les maladies rares. La saisie des données est contrainte par une terminologie prédéfinie qui associe à chaque information un nombre et/ou un code.

Le traitement des données est d’autant plus aisé que leur niveau de structuration est important. Certaines utilisations des données peuvent nécessiter de faire passer des données d’un format non structuré à un format structuré en les codant selon des terminologies.

1.2       Codage de l’information : exemple du PMSI

Le Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information a pour but de décrire l’activité d’hospitalisation de tous les établissements de santé en France. Le PMSI sert à la compensation financière des établissements de santé suite à la mise en place de la tarification à l’activité (T2A).

Exemple de codage du diagnostic principal d’un séjour dans une unité médicale de chirurgie orthopédique



PMSI : dans chaque établissement de santé, les Départements d’Information Médicale transmettent mensuellement des informations à l’Agence Régionale de Santé. Ces informations issues des données des dossiers du patient sont codées selon des terminologies : par exemple, la CIM-10 (Classification Internationale des Maladies version n°10) pour les diagnostics et la CCAM (Classification Commune des Actes médicaux) pour les actes médicaux.


2        Gestion de l’information médicale

2.1       Au niveau local

2.1.1      Pour le soin

Le système d’Information Hospitalier (SIH)

Il est composé de logiciels interconnectés et spécialisés. Par exemple, les activités liées à l'imagerie reposent sur le système de radiologie (scanner, IRM, échographe, etc.), des logiciels de gestion des images (PACS) et de production des comptes rendus. Le dossier patient informatisé (DPI) est un composant logiciel essentiel d'un SIH. Il centralise l'ensemble des données du patient produites à l'hôpital et permet aux professionnels de santé d'échanger des informations.

Le système d’information hors établissement de santé

Les cabinets médicaux sont dotés de systèmes comprenant des équipements (réseau, PC, lecteur de carte CPS et SESAM-Vitale, imprimante-scanner, etc.) et un logiciel de gestion du cabinet offrant des fonctionnalités de gestion de rendez-vous, dossier médical, prescriptions et import des résultats d'analyses de biologie médicale.

2.1.2      Pour des finalités autre que le soin

Les entrepôts de données de santé permettent de décloisonner les données produites lors du processus de soins et de les intégrer dans une même base, afin de les réutiliser à d’autres fins que le soin (ex : la recherche, les vigilances, le pilotage).

2.2       Au niveau national

2.2.1      Pour le soin

Mon espace santé est une plateforme comportant le dossier médical partagé entre des professionnels de santé, une messagerie sécurisée, des services applicatifs afin de faciliter la communication entre les professionnels de santé et le patient.

2.2.2      Pour des finalités autres que le soin

Le système national des données de santé est un dispositif national qui intègre plusieurs bases de données, notamment : les données du Système National d’Information Inter-régimes de l’Assurance Maladie (SNIIRAM), les données PMSI, les causes médicales de décès et les données relatives au handicap.

3        Publication, évaluation

Pour une partie d’entre eux, les indicateurs de qualité et sécurité des soins (IQSS) développés par l'HAS reposent directement sur des données de santé :

  • les indicateurs sur dossier du patient : sur la tenue du dossier du patient, la qualité de la lettre de liaison à la sortie, l'évaluation et la prise en charge de la douleur, le dépistage des troubles nutritionnels, etc.
  • les indicateurs calculés à partir de la base nationale du PMSI : les réadmissions dans les 7 jours suivant un séjour conventionnel, les réadmissions dans les 3 jours après une chirurgie ambulatoire, etc.


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